根据《中央生态环境保护督察工作规定》，中央第六生态环境保护督察组（以下简称督察组）对湖南省开展了第二轮生态环境保护督察。2021年5月28日，中央生态环境保护督察工作领导小组第三次会议审议通过督察报告。经党中央、国务院批准，督察组于2021年7月16日向湖南省委、省政府进行反馈。
湖南省高度重视此次督察工作，边督边改、立行立改，解决了一批群众身边的生态环境问题。截至6月底，督察组交办的3321件群众举报问题已办结或阶段办结3091件，其中责令整改1862家；立案处罚419家，罚款2251.82万元；立案侦查56件，拘留48人，约谈194人，问责217人。督察指出，湖南省生态环境保护工作虽然取得重要进展和成效，但与预期，仍有不少差距。
一是贯彻落实生态文明思想有差距。
存在“两高”项目上马冲动现象，一些不符合要求的项目坚持续建。湖南省在编制省“十四五”能源发展规划时，未落实《关于全面推动矿业绿色发展的若干意见》“全面退出石煤开发”要求，仍允许怀化发电项目采用当地石煤作为燃料，环境风险隐患较大。湘钢集团东安石灰石矿资源综合利用项目未进行能源评估就已开工建设。化解过剩产能不够有力，怀化市为引进日产8000吨熟料水泥生产线，在省内熟料产能过剩的情况下，依然接受其他省外出让熟料产能进行置换。
省级统筹谋划不够。湖南省对矿山生态修复、重金属污染治理、矿涌水治理等历史遗留问题，统筹谋划、指导帮扶不够；一些地方一味“等靠要”，工作标准不高，导致一些重点工作推进迟缓。郴州市鲁塘矿区废弃矿山占地560公顷，遗留生态环境问题长达十余年未开展整治；全省数十万吨历史遗留及每年新产生的数千吨砷碱渣未得到有效处置；一些地方矿涌水治理投资巨大，效果不佳。
二是重金属和矿山污染问题依然突出。
湖南省部分区域及工矿场地重金属污染严重，涉重尾矿库、废弃矿山多。部分历史遗留涉重废渣治理进展迟缓。
大部分在产砂石土矿存在越界开采、侵占林地、超规模开采等问题。邵阳县长阳矿区2万余吨废渣侵占土地；娄底市2020年砂石土矿开采量达4304万吨，超出“十三五”规划要求的年开采量近1倍。怀化市溆浦县5家硅砂开采企业附近山体植被大面积被破坏。张家界市210多家大理石、方解石采石制砂企业，多点无序开发，非法毁林占地时有发生。
全省各类废弃矿山达6950座，大部分未落实“谁开发、谁治理”要求，生态修复率不到45%，部分修复工程浮皮潦草。怀化市547座废弃矿山，70%未开展治理修复，大量酸性含重金属淋溶水直排。娄底市368座废弃矿山中超过三分之二未开展治理修复，其中79个矿洞排放强酸性废水。部分尾矿库环境安全隐患较为突出，湘西州49座需要开展治理或闭库尾矿库，仅完成闭库10座。邵阳市应完成治理的26座尾矿库，尚有11座未开展治理。此外，废弃矿山生态修复机制不够完善，后续恢复治理多由属地政府兜底埋单。